Nació el 4 de octubre de 1940, en Ciudad Vieja en el departamento de Sacatepéquez, Guatemala.
Morales Santos fue miembro fundador del grupo Nuevo Signo. Dirigió los tres únicos números del periódico La gran flauta y de la edición de Las plumas de la serpiente, antología del grupo. Ha obtenido el Primer Premio en los Juegos Florales Centroamericanos de Quezaltenango, y Premio Único en 1978 en el Festival Nacional de Arte de la Universidad de San Carlos de Guatemala. Ha colaborado en periódicos y revistas de Guatemala, México, El Salvador, Costa Rica y Colombia. También ha incursionado en la crítica literaria.
Ha publicado en poesía: Agua en el silencio(1961),Ciudades en el llanto (1963 y 1965), Germinación de la luz (1966), Nimayá (1968), Sensación de lo lejano (1968), Tenebrario (1969), Escrito sobre olivos (1971), Cuerno de incendio (1976), Cartas para seguir con vida (1977 y 1993), Ceremonial para el olvido (1979), Poesía para lugares públicos (1976
Antologías: Los nombres que nos nombran: panorama de la poesía guatemalteca, de 1782 a 1982 (1983), Exodus: an anthology de Guatemalan poets (1988), Nueva poesía guatemalteca (1990), Nosotros, los de entonces: antología (1993), Preguntas a causa de la poesía (Fco. Morales Santos, Osvaldo Sauma, José Luis Quesada)(2002). Compilador: Poemas del volcán de fuego (1998) (Poemas de Luis de Lión), Páginas de lumbre de Miguel Angel Asturias (1999), Poemas escogidos para niños (1999), Vida y milagros de Miguel Angel Asturias (1999).
Estudios: El hermano Pedro Betancur: primer santo de América Central (1980), Los barriletes gigantes de Santiago Sacatepéquez (1970), Quezaltenango en la poesía (1975).
